Wodne pompy akwarystyczne znajdują swoje szerokie zastosowanie od zastosowania przy produkcji własnych filtrów, aż po różne działania związane z przepompowywaniem wody podczas czyszczeniu akwarium. Ze względu na ich funkcję na rynku istnieje kilka rodzajów pomp. Akwariowe pompy ssące znajdują zastosowanie przy budowie własnego filtra lub odsysania wody przy ich wymianach. Pompy obiegowe są przeznaczone do akwariów w których jest wymagane zapewnienie stałego przepływu. Są idealne dla morskich i roślinnych akwariów lub tam, gdzie ryby wymagają wysokiej jakości przepływu. Ostatnim typem są pompy głowicowe, które można nasadzić na biogąbki i zastosować je jako filtry wewnętrzne.